「魔法工房」は、「魔法」をテーマとするシミュレーションゲーム。
物語は世界が生まれる前からはじまった。とある日、宇宙に「水・火・大気・土」という4つの相克・相和の元素が現れた。学者である初代校長は、研究と実験によって元素に潜み、世界誕生の秘密を発見した。それをより深く研究するために、マジックアカデミーを創設した。しかしそれはパンドラの箱を開けてしまい、次第に魔物の侵入を引き寄せ、マジックアカデミーも破壊され、初代校長まで姿が消えてしまった。
魔物の侵入で廃墟になったマジックアカデミ。今こそ、あなたの力が必要です～！ 新しい魔法の研究とアイテムの合成で実力をつけて、マジックアカデミーを再建しょう！魔物を追い払い、光を大陸に取り戻ろう！